核内蛋白質・核酸複合体の動的モデリング(量研機構・河野)

理研杉田と協力して、ABMDアルゴリズムをGENESIS に実装することにより、大きな構造変形を引き起こす過程の詳細なメカニズムを調べる。下図は、蛋白質8量体とDNAの複合体であるヌクレオソーム(クロマチンの基本構造単位)からH2A-H2B dimer が離脱していく過程の一例。
Ishida, Kono: J. Mole. Biol. in press